Bernard Allaire est un historien spécialiste des sociétés et des économies urbaines et maritimes de l'Europe et de l'Amérique du Nord. Il est impliqué dans plusieurs projets de recherche à caractère historique et archéologique avec des chercheurs de tous horizons. Il aime particulièrement les projets qui viennent compléter le travail de l'archéologie, de l'histoire des Autochtones, de l'alimentation, des sciences et techniques, des métiers ou des réseaux de correspondances. Il travaille dans les bibliothèques et centres d’archives et dans ses propres banques de données pour des gouvernements, des collectivités, des universitaires, des juristes et des particuliers à l’identification, la numérisation et la translittération de sources manuscrites pertinentes à leurs besoins. Il est l'auteur de : Pelleteries, manchons et chapeaux de castor, Québec / Paris, Septentrion et PUPS, 1999 (Prix Falardeau) et de Crépuscules ultramontains, Bordeaux PUB, 2008 (Prix Desgraves) et La Rumeur Dorée: Roberval et l'Amérique, Montréal, éd. de La Presse, 2013 ; un collectif avec Maria Fusaro, Richard Blakemore and Tijl Vanneste Law, Labour and Empire, London, Palgrave Macmillan, 2015 et une issue spéciale de la revue Terrae Incognitae sur l'histoire des pêches (2025). Il a participé à de nombreux ouvrages collectifs, publié dans des revues et donné des conférences, mais l'essentiel de son travail est cependant constitué par des dizaines de rapports de recherche non publiés ou confidentiels sur une vaste gamme de sujets.